La gingivectomía resulta muy útil para minimizar el acúmulo de placa y mejorar la higiene bucodental, ya que la hiperplasia (o sobrecrecimiento) de la encía, impide en muchos casos realizar un correcto mantenimiento de la higiene y agrava la patología periodontal.
Sin embargo, la aplicación de la gingivectomía en el tratamiento de la enfermedad periodontal es limitada, ya que no podrá realizarse cuando existan lesiones periodontales infraóseas. Tampoco cuando la incisión eliminaría toda la encía queratinizada (que protege al diente).